La historia de la Parroquia Santiago de los Valles está relacionada con los primeros años del actual Ciudad Valles. De acuerdo con registros históricos, el proceso de evangelización inició el 25 de julio de 1533 con la llegada de Nuño Beltrán. La primera iglesia fue edificada con palma y otate, pero fue destruida por un incendio en 1534.
Tras su reconstrucción, un segundo incendio ocurrido en 1590 ocasionó la pérdida total de los archivos históricos del templo. En 1593, por orden del virrey Luis de Velasco, comenzó la construcción de una nueva edificación con materiales más resistentes, cuya obra concluyó en 1607.
A lo largo de los siglos, el inmueble ha permanecido como uno de los principales referentes históricos, culturales y religiosos de la región Huasteca. Durante ese periodo enfrentó diversos acontecimientos, entre ellos la Revolución Mexicana y la Guerra Cristera.
La parroquia fue restaurada en 1934 por el padre Xavier Enrique Guerrero Briones y nuevamente en 1993 por el arquitecto Juan Antonio Luna Nava, con trabajos orientados a la conservación del edificio. La información se basa en Historia de Valles, de Joaquín Meade (pp. 194-195), y en datos proporcionados por el cronista municipal, Crescencio Martínez Candelario.
